W celu zapewnienia skoordynowanego nadzoru nad systemem Eurodac, krajowe organy nadzorcze oraz Europejski Inspektor Ochrony Danych, działając w granicach swych kompetencji, aktywnie współpracują oraz spotykają się przynajmniej dwa razy w roku w ramach Grupy ds. Koordynacji Nadzoru nad Systemem Eurodac. W skład Grupy wchodzą organy reprezentujące 28 państw członkowskich UE, a także takie państwa jak Islandia, Liechtenstein, Norwegia i Szwajcaria. Grupie przewodniczy obecnie szwedzki organ ochrony danych, a bułgarski organ ochrony danych pełni funkcję wiceprzewodniczącego.
W ramach współpracy i cyklicznych spotkań członkowie grupy:
- wymieniają stosowne informacje;
- pomagają sobie wzajemnie w prowadzeniu kontroli i inspekcji;
- analizują trudności w interpretowaniu lub stosowaniu podstaw prawnych funkcjonowania systemu Eurodac;
- badają problemy związane ze sprawowaniem niezależnego nadzoru lub wykonywaniem praw przysługujących osobom, których dane dotyczą;
- opracowują zharmonizowane propozycje wspólnych rozwiązań wszelkich problemów oraz propagują wiedzę na temat praw związanych z ochroną danych.
Wspólne sprawozdanie z działalności przesyłane jest co dwa lata Parlamentowi Europejskiemu, Radzie, Komisji i Agencji (eu-LISA).
Bardziej szczegółowe informacje na temat Grupy ds. Koordynacji Nadzoru nad Systemem Eurodac dostępne są na jej stronie internetowej
Informacje o sposobach realizacji swoich praw na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej w zakresie danych przetwarzanych w systemie Eurodac można uzyskać na stronie internetowej Szefa Urzędu ds. Cudzoziemców.